8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1182 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1182  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  280  6.000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422809  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1692  DNA polymerase beta subunit  38.26 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000104871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0185  DNA polymerase, beta-like region  32.69 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.519951 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0320  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1438  DNA polymerase beta subunit  31.9 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000026658  hitchhiker  0.0000058254 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1588  hypothetical protein  28.28 
 
 		 146 aa  48.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0209  hypothetical protein  26.36 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.184699  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1252  DNA polymerase beta subunit  25.93 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>