16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0991 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0991  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 111 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2681  DNA polymerase beta domain protein region  54.87 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1689  DNA polymerase beta subunit  62.24 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000949041  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1278  DNA polymerase beta subunit  55.36 
 
 		 113 aa  115  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0999  DNA polymerase beta subunit  46.73 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0343888  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1435  DNA polymerase beta subunit  43.81 
 
 		 109 aa  80.5  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000437505  decreased coverage  0.0000020199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1268  DNA polymerase beta subunit  50.51 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.834804 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  39.36 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  35.78 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  42.39 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  39.77 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  36 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  32.61 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0464  DNA polymerase beta subunit  48.78 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0242812  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  24.74 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1433  DNA polymerase beta subunit  29.46 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.855989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>