52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4180 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4180  Protein of unknown function DUF2236  100 
 
 		 315 aa  641    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0423  hypothetical protein  53.23 
 
 		 285 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.194905  normal  0.351436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0247  hypothetical protein  50.79 
 
 		 342 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.784413  normal  0.235589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5145  hypothetical protein  51.75 
 
 		 321 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5526  hypothetical protein  51.75 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal  0.383674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5234  hypothetical protein  51.75 
 
 		 343 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0324679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1497  Protein of unknown function DUF2236  49.24 
 
 		 304 aa  238  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0368  hypothetical protein  42.47 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644221  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0357  hypothetical protein  42.47 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0378  hypothetical protein  42.47 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10280  hypothetical protein  45.69 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.23814e-37  normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12266  hypothetical protein  46.42 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4848  Protein of unknown function DUF2236  42.81 
 
 		 277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0330  hypothetical protein  44.96 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.80625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20310  hypothetical protein  45.25 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.22051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0410  hypothetical protein  43.82 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4522  Protein of unknown function DUF2236  43.46 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4085  Protein of unknown function DUF2236  36.94 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1211  Protein of unknown function DUF2236  43.24 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3568  hypothetical protein  30.61 
 
 		 257 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21310  hypothetical protein  30.37 
 
 		 290 aa  94.4  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3288  hypothetical protein  29.84 
 
 		 268 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02678  conserved hypothetical protein  27.74 
 
 		 292 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7363  hypothetical protein  30.8 
 
 		 261 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5301  Protein of unknown function DUF2236  32 
 
 		 285 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0527126  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08419  conserved hypothetical protein  28.49 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0824  hypothetical protein  26.94 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352162  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0861  hypothetical protein  27.13 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0213218  normal  0.737797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0581  hypothetical protein  23.62 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0734  hypothetical protein  23.76 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0345739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0728  hypothetical protein  23.76 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1212  Protein of unknown function DUF2236  25.67 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0748  hypothetical protein  23.76 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8288  hypothetical protein  22.04 
 
 		 294 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5273  hypothetical protein  25.54 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1308  hypothetical protein  27.23 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0861695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1496  Protein of unknown function DUF2236  25.73 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.712193  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2969  hypothetical protein  26.25 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0397  hypothetical protein  25.97 
 
 		 267 aa  49.7  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3777  hypothetical protein  26.67 
 
 		 299 aa  49.3  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.079165  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11662  hypothetical protein  20 
 
 		 351 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.966236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3564  Protein of unknown function DUF2236  24.32 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0400782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5869  Protein of unknown function DUF2236  23.72 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.171414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3796  Protein of unknown function DUF2236  21.65 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4439  hypothetical protein  30.3 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0497  hypothetical protein  22.27 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.414796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4278  hypothetical protein  30.3 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4212  hypothetical protein  27.48 
 
 		 334 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1349  Protein of unknown function DUF2236  23.85 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.0637493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2494  Protein of unknown function DUF2236  22.3 
 
 		 339 aa  43.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4257  Protein of unknown function DUF2236  23.81 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.335459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3974  hypothetical protein  26.27 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763753  normal  0.443547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>