28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3853 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3853  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  274  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3969  hypothetical protein  56.72 
 
 		 149 aa  157  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1249  hypothetical protein  52.31 
 
 		 147 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.64479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4417  nuclear transport factor 2  42.96 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4586  nuclear transport factor 2  39.53 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4674  nuclear transport factor 2  39.53 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4969  nuclear transport factor 2  39.53 
 
 		 143 aa  94  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1592  nuclear transport factor 2  38.89 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5165  nuclear transport factor 2  37.6 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10775  hypothetical protein  36.8 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2441  hypothetical protein  31.45 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.655393  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4985  steroid delta-5-3-ketosteroid isomerase  30.83 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4214  nuclear transport factor 2  39 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4370  nuclear transport factor 2  39 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0442394  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4139  nuclear transport factor 2  39 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2053  nuclear transport factor 2  37 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.153655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2031  putative ketosteroid isomerase  22.31 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4664  nuclear transport factor 2  37 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1487  Ketosteroid isomerase-related protein-like protein  26.9 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.71632 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3765  nuclear transport factor 2  33.33 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581539  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  33.66 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3295  nuclear transport factor 2  29.84 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3431  nuclear transport factor 2  47.83 
 
 		 267 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12079  hypothetical protein  30.08 
 
 		 265 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2932  nuclear transport factor 2  26.5 
 
 		 274 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2888  nuclear transport factor 2  26.5 
 
 		 274 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0754079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3803  hypothetical protein  29.91 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2918  nuclear transport factor 2  26.5 
 
 		 274 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.200608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>