More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2187 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2187  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  100 
 
 
302 aa  586  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.383542  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1839  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.13 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.166294  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3222  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.16 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2671  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.39 
 
 
320 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.199092  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  38.34 
 
 
310 aa  172  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4031  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.76 
 
 
312 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5462  esterase/lipase/thioesterase  40.5 
 
 
311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.536989  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2443  putative lipase  36.97 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2479  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.61 
 
 
313 aa  162  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.26249  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1665  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40 
 
 
313 aa  162  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.414824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1213  lipolytic protein  37.1 
 
 
309 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583626  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0952  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.68 
 
 
318 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0604  esterase/lipase-like protein  35.43 
 
 
346 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000548029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2662  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.41 
 
 
313 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3121  esterase/lipase/thioesterase  38.01 
 
 
321 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3653  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.46 
 
 
308 aa  153  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3830  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.1 
 
 
311 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0942  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.93 
 
 
312 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.911706  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0880  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.66 
 
 
324 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.691733  hitchhiker  0.0000246401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1447  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.66 
 
 
308 aa  148  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2162  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.75 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2844  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.49 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.446939  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6313  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  36.7 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.179325  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3757  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.98 
 
 
311 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.315687 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2517  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.22 
 
 
323 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1537  lipolytic protein  39.66 
 
 
318 aa  146  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000528451  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4203  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40 
 
 
375 aa  145  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307246  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3028  esterase/lipase/thioesterase  35.56 
 
 
314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0380453  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2218  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.95 
 
 
382 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000644131  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2420  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.82 
 
 
314 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40186  normal  0.0240914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4942  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.62 
 
 
314 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3113  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.71 
 
 
337 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723098  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0292  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.5 
 
 
316 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0301  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.5 
 
 
316 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.234929  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4562  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.44 
 
 
314 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0210924  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0311  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.5 
 
 
316 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.207526 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2599  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  41.11 
 
 
370 aa  142  8e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0758  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.07 
 
 
376 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0959861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1441  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.86 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2875  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  40.25 
 
 
310 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.406722  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2306  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.54 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0482  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.19 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.459032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0305  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.56 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1307  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.42 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2623  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.33 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.04826  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.49 
 
 
320 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5215  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.47 
 
 
311 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85138  normal  0.647883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0314  Alpha/beta hydrolase fold-3  41.13 
 
 
310 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0217857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0324  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.13 
 
 
310 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381561  normal  0.441011 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1856  hypothetical protein  33.86 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1851  hypothetical protein  33.86 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1023  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  45.29 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7511  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.08 
 
 
315 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1791  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.22 
 
 
281 aa  136  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3375  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  32.08 
 
 
350 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354679  normal  0.126247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4223  putative lipase/esterase  36.94 
 
 
320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0983  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.84 
 
 
309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.875721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2418  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.83 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382013  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2424  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.83 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0082744  normal  0.188139 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2377  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.83 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2703  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.17 
 
 
316 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00278676  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11429  lipase lipH  39.52 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.4414e-17  normal  0.258557 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3782  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.07 
 
 
311 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2768  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.59 
 
 
308 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.718585 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4884  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.04 
 
 
289 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.34 
 
 
340 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.884364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3180  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.46 
 
 
324 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407678  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1039  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.25 
 
 
319 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.240306  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1487  putative lipase/esterase  39.33 
 
 
305 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0809512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3154  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.14 
 
 
292 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1266  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.99 
 
 
628 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.19561  hitchhiker  0.00155525 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5478  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37 
 
 
317 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.157645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.9 
 
 
307 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0574937 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0328  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.11 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2006  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.36 
 
 
352 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.368207  normal  0.502337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3867  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.62 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.695714  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6777  lipolytic protein  35.87 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2672  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.92 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795558  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11428  lipase lipH  39.3 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.13371e-22  normal  0.199346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1713  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.22 
 
 
329 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386293  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2011  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.24 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.706628  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1345  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  32.97 
 
 
349 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1555  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.45 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2094  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.72 
 
 
339 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317288  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1786  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.33 
 
 
317 aa  129  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  hitchhiker  0.00646519 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1072  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.99 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6617  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.63 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.141576 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1940  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.52 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.50518  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5601  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.13 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1986  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.52 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2028  Alpha/beta hydrolase fold-3  38.24 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1991  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.12 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2074  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.24 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1935  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.45 
 
 
319 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0879113  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12985  lipase/esterase lipN  36.36 
 
 
376 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2464  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.59 
 
 
317 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000166142  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3735  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.58 
 
 
310 aa  126  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0759445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3090  esterase/lipase/thioesterase  38.01 
 
 
312 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2890  putative lipase/carboxylesterase protein  39.81 
 
 
290 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.475117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3992  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.72 
 
 
304 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292538  normal  0.502023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>