26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1257 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1257  Protein of unknown function DUF2550  100 
 
 		 144 aa  285  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182899  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1923  Protein of unknown function DUF2550  50.43 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.701669  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3874  hypothetical protein  42.65 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0531826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3948  hypothetical protein  42.65 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000500606  decreased coverage  0.0034506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3860  hypothetical protein  42.65 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00794902  normal  0.0107647 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11339  hypothetical protein  43.36 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4326  hypothetical protein  44.74 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0306125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2320  hypothetical protein  45.54 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6134  hypothetical protein  37.88 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2603  hypothetical protein  34.38 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00061892  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1765  hypothetical protein  33.82 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29530  Protein of unknown function (DUF2550)  39.32 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.320914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1838  hypothetical protein  30.91 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2336  hypothetical protein  31.82 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3627  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4009  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2405  putative secreted/membrane protein  36.13 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2129  hypothetical protein  37.19 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000883377  hitchhiker  0.00515414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3914  hypothetical protein  36.27 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.693365  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1272  hypothetical protein  37.36 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.704856  normal  0.492421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0338  Protein of unknown function DUF2550  34.82 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1309  hypothetical protein  31.16 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.498148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4133  Protein of unknown function DUF2550  30.84 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.857839  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1220  hypothetical protein  25.95 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1673  hypothetical protein  31.68 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0655  hypothetical protein  31.4 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.691478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>