12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0227 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1320  hypothetical protein  87.2 
 
 
375 aa  668    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0227  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  754    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0212  hypothetical protein  64.64 
 
 
362 aa  474  1e-132  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.931385 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0743  hypothetical protein  57.53 
 
 
367 aa  414  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000046156 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1654  hypothetical protein  36.79 
 
 
413 aa  220  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0267  hypothetical protein  33.61 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0597418  hitchhiker  0.000000218565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0329  hypothetical protein  24.94 
 
 
371 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2002  hypothetical protein  29.37 
 
 
386 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1032  hypothetical protein  43.04 
 
 
379 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.775746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  27.44 
 
 
445 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1559  L-fucose isomerase and related proteins-like  29.95 
 
 
451 aa  53.9  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0468  L-fucose isomerase-like protein  24.06 
 
 
467 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>