14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0743 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0743  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  746    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000046156 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0212  hypothetical protein  60.95 
 
 
362 aa  434  1e-121  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.931385 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1320  hypothetical protein  58.22 
 
 
375 aa  425  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0227  hypothetical protein  57.53 
 
 
375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1654  hypothetical protein  39.64 
 
 
413 aa  250  3e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0267  hypothetical protein  31.62 
 
 
395 aa  207  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0597418  hitchhiker  0.000000218565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0329  hypothetical protein  26.9 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2002  hypothetical protein  28.01 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1032  hypothetical protein  26.74 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.775746 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1559  L-fucose isomerase and related proteins-like  30.46 
 
 
451 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  22.99 
 
 
445 aa  59.3  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0491  L-fucose isomerase-like protein  28.57 
 
 
439 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1106  L-fucose isomerase and related protein-like protein  27.48 
 
 
435 aa  50.4  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.818245  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0229  hypothetical protein  27.23 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.745759  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>