14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1559 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1559  L-fucose isomerase and related proteins-like  100 
 
 
451 aa  908    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0329  hypothetical protein  27.45 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1654  hypothetical protein  25.94 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0267  hypothetical protein  27.01 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0597418  hitchhiker  0.000000218565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0743  hypothetical protein  30.46 
 
 
367 aa  64.3  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000046156 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1032  hypothetical protein  26.32 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.775746 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2002  hypothetical protein  26.32 
 
 
386 aa  58.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0227  hypothetical protein  29.95 
 
 
375 aa  54.3  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0212  hypothetical protein  28.89 
 
 
362 aa  53.5  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.931385 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1320  hypothetical protein  24.76 
 
 
375 aa  53.5  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1106  L-fucose isomerase and related protein-like protein  21.99 
 
 
435 aa  52.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.818245  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0229  hypothetical protein  22.84 
 
 
435 aa  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.745759  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0491  L-fucose isomerase-like protein  20.43 
 
 
439 aa  47  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  28.35 
 
 
445 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>