12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2002 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2002  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  754    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1032  hypothetical protein  66.58 
 
 		 379 aa  468  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.775746 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0267  hypothetical protein  28.7 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0597418  hitchhiker  0.000000218565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0743  hypothetical protein  28.01 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000046156 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0227  hypothetical protein  29.1 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1320  hypothetical protein  28.91 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0329  hypothetical protein  21.45 
 
 		 371 aa  91.3  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0212  hypothetical protein  28.69 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.931385 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1654  hypothetical protein  30.42 
 
 		 413 aa  87  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1559  L-fucose isomerase and related proteins-like  26.32 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2456  hypothetical protein  27.1 
 
 		 440 aa  49.7  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0491  L-fucose isomerase-like protein  24.16 
 
 		 439 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>