18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1103 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1103  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  413  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148506  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0532  hypothetical protein  32.46 
 
 
208 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0304  hypothetical protein  34.67 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0820  hypothetical protein  35.14 
 
 
221 aa  85.5  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067101  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2111  hypothetical protein  36.16 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0986  hypothetical protein  31.5 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.628076  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1599  hypothetical protein  30.77 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.114098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3621  hypothetical protein  28.88 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.537291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0520  hypothetical protein  33.93 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.196458  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1009  hypothetical protein  29.87 
 
 
214 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2263  hypothetical protein  30.86 
 
 
221 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2057  hypothetical protein  31.48 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.61139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1053  hypothetical protein  31.21 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1847  hypothetical protein  29.01 
 
 
227 aa  54.7  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2229  hypothetical protein  39.68 
 
 
81 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.207384  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0576  hypothetical protein  27.27 
 
 
206 aa  42.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805789  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0798  hypothetical protein  25.58 
 
 
310 aa  42  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0809  hypothetical protein  25.58 
 
 
317 aa  42  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.284049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>