More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0525 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0525  Cof-like hydrolase  100 
 
 
265 aa  526  1e-148  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  45.28 
 
 
270 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  43.56 
 
 
268 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  43.4 
 
 
264 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  42.32 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  29.8 
 
 
272 aa  125  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  33.07 
 
 
262 aa  125  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  33.73 
 
 
266 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  29.23 
 
 
268 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  31.4 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  33.46 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0900  HAD superfamily hydrolase  32.34 
 
 
268 aa  115  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  31.2 
 
 
269 aa  115  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  31.7 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  31.7 
 
 
267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  31.3 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2434  Cof protein  25 
 
 
282 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4042  Cof-like hydrolase  26.01 
 
 
271 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4000  Cof-like hydrolase  26.01 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  28.06 
 
 
268 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  31.42 
 
 
278 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2460  HAD superfamily hydrolase  32.02 
 
 
257 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00284871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  32.47 
 
 
273 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1845  HAD superfamily hydrolase  27.55 
 
 
269 aa  100  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  28.12 
 
 
272 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  28.69 
 
 
268 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2525  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.52 
 
 
257 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000564566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1119  Cof-like hydrolase  25.78 
 
 
271 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.78603  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0374  HAD superfamily hydrolase  29.93 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0519666  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  29.01 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.61 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  28.15 
 
 
270 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  31.94 
 
 
266 aa  95.5  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  26.87 
 
 
271 aa  95.5  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2261  HAD superfamily hydrolase  28.96 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.839309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2426  HAD superfamily hydrolase  28.96 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4195  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.4 
 
 
267 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0996454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3223  Cof-like hydrolase  25 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1895  HAD superfamily hydrolase  31.9 
 
 
278 aa  95.1  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000132103  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0362  HAD superfamily hydrolase  30.29 
 
 
270 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.133771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  27.69 
 
 
269 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2444  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.96 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.385743 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0138  Cof-like hydrolase  24.53 
 
 
279 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1752  HAD family hydrolase  24.62 
 
 
271 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00695054  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  26.62 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  33.21 
 
 
273 aa  91.3  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4133  HAD family hydrolase  27.42 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1066  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.23 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.840959  normal  0.475939 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3804  HAD-superfamily hydrolase  26.69 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3819  HAD-superfamily hydrolase  26.69 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.126763  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  28.12 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.69 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119194 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3974  HAD family hydrolase  26.69 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4285  HAD family hydrolase  26.69 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0569  Cof-like hydrolase  30.38 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122616  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  28.85 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  26.42 
 
 
271 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  26.97 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3893  Cof-like hydrolase  27.09 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.805334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  29.77 
 
 
275 aa  90.1  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4172  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.89 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0575456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  27.92 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  26.97 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  26.97 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  26.97 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  26.97 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.97 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  27.39 
 
 
273 aa  89  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.97 
 
 
273 aa  89  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.97 
 
 
273 aa  89  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  26.15 
 
 
272 aa  89  8e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.97 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  28.46 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2751  Cof-like hydrolase  29.2 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.181052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2702  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.54 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2762  Cof-like hydrolase  28.24 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2661  HAD superfamily hydrolase  27.6 
 
 
283 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000702252  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  28.1 
 
 
270 aa  86.7  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3074  Cof-like hydrolase  26.74 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2418  HAD superfamily hydrolase  28.32 
 
 
283 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  27.27 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0324  Cof-like hydrolase  27.72 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000119179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2454  HAD superfamily hydrolase  28.32 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2506  Cof-like hydrolase  28.67 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0188356  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2379  HAD superfamily hydrolase  28.32 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2634  HAD superfamily hydrolase  28.32 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0365  HAD superfamily hydrolase  31.85 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.231869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2652  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.32 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000241821 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  25.99 
 
 
273 aa  85.9  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  26.1 
 
 
281 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  26.91 
 
 
273 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2658  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.96 
 
 
283 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  26.1 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  25.91 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1851  Cof-like hydrolase  27.14 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  26.47 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4183  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.94 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000631727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  26.47 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  26.47 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>