31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2815 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0638  hypothetical protein  67.08 
 
 
559 aa  654    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2815  hypothetical protein  100 
 
 
573 aa  1140    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0997  hypothetical protein  66.2 
 
 
552 aa  657    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1451  hypothetical protein  62.37 
 
 
551 aa  636    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1317  hypothetical protein  61.89 
 
 
559 aa  624  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195654  normal  0.119576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2292  hypothetical protein  61.93 
 
 
559 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0363731  hitchhiker  0.000163049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1229  hypothetical protein  61.52 
 
 
550 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.445379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0565  hypothetical protein  60.18 
 
 
541 aa  609  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3379  hypothetical protein  60.98 
 
 
554 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60985  normal  0.431334 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1664  hypothetical protein  57.92 
 
 
574 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4144  hypothetical protein  61.17 
 
 
530 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462291  hitchhiker  0.000193551 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0478  hypothetical protein  56.39 
 
 
574 aa  590  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1527  hypothetical protein  47.08 
 
 
586 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2334  hypothetical protein  77.41 
 
 
552 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4454  hypothetical protein  45.76 
 
 
575 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59070  hypothetical protein  45.09 
 
 
579 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000160429  normal  0.0321205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2995  hypothetical protein  41.67 
 
 
528 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2915  hypothetical protein  48.64 
 
 
512 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3287  hypothetical protein  48.72 
 
 
499 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3746  hypothetical protein  35.94 
 
 
548 aa  261  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1721  hypothetical protein  31.91 
 
 
568 aa  247  4e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4114  hypothetical protein  34.3 
 
 
581 aa  247  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1348  hypothetical protein  31.56 
 
 
568 aa  246  6.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0608  hypothetical protein  35.28 
 
 
574 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0303  hypothetical protein  34.57 
 
 
578 aa  243  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000587297 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0642  hypothetical protein  41.15 
 
 
331 aa  181  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0619  hypothetical protein  34.15 
 
 
510 aa  176  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2677  hypothetical protein  33.52 
 
 
569 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.22 
 
 
462 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  28.68 
 
 
293 aa  44.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  29.35 
 
 
2179 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>