More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1093 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1093  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.605646  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  53.21 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  50.36 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  47.84 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  45.36 
 
 		 332 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  45.16 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  45 
 
 		 298 aa  258  8e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  46.43 
 
 		 298 aa  258  8e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  44.6 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  44.64 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  43.57 
 
 		 334 aa  255  6e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2244  GTP-binding protein Era  46.24 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  43.93 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  43.93 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  43.93 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  43.93 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  43.21 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  43.93 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  45.58 
 
 		 299 aa  252  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 		 338 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  41.79 
 
 		 311 aa  251  6e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 		 338 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 		 338 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 		 338 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  45.16 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  45.16 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  45.16 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  44.8 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02424  hypothetical protein  45.16 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  44.8 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 334 aa  250  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  45.16 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  44.8 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  45.16 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  41.43 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  46.04 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  45.16 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  45.16 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  45.16 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3053  GTP-binding protein Era  44.09 
 
 		 301 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  44.8 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3950  GTP-binding protein Era  48.56 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2958  GTP-binding protein Era  44.8 
 
 		 301 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2742  GTP-binding protein Era  44.8 
 
 		 301 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2823  GTP-binding protein Era  44.8 
 
 		 301 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  43.21 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  45.16 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  44.29 
 
 		 295 aa  248  9e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  42.5 
 
 		 329 aa  248  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2783  GTP-binding protein Era  44.8 
 
 		 301 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2846  GTP-binding protein Era  44.8 
 
 		 301 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  0.818064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4216  GTP-binding protein Era  48.2 
 
 		 300 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  44.44 
 
 		 314 aa  247  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1055  GTP-binding protein Era  42.5 
 
 		 331 aa  245  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.305359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  44.84 
 
 		 324 aa  245  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2524  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00258575  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  43.57 
 
 		 295 aa  242  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  46.04 
 
 		 306 aa  242  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0033  GTP-binding protein Era  44.6 
 
 		 305 aa  242  5e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  42.7 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  41.79 
 
 		 297 aa  241  7e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  41.43 
 
 		 320 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1074  GTP-binding protein Era  46.4 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0995  GTP-binding protein Era  46.4 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4748  GTP-binding protein Era  46.4 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0521069  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01718  GTP-binding protein Era  46.07 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.515078  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1476  GTP-binding protein Era  46.04 
 
 		 299 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  43.17 
 
 		 298 aa  239  5e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4287  GTP-binding protein Era  46.04 
 
 		 300 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13790  GTP-binding protein Era  47.12 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264209  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54320  GTP-binding protein Era  46.04 
 
 		 305 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1434  GTP-binding protein Era  45.68 
 
 		 302 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  42.46 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4373  GTP-binding protein Era  45.68 
 
 		 300 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  42.46 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0375  GTP-binding protein Era  43.79 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.426985  hitchhiker  0.000823221 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  42.25 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  41.07 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1197  GTP-binding protein Era  42.11 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1015  GTP-binding protein Era  41.79 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  41.43 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  41.79 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  41.79 
 
 		 314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  41.43 
 
 		 299 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  44.17 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  41.43 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  41.07 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>