22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0559 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0559  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 		 340 aa  690    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0195  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  57.61 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.00000014787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2287  hypothetical protein  54.73 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.377125  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1016  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  51.46 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2306  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  51.05 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  0.0574212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2113  hypothetical protein  40.95 
 
 		 353 aa  276  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0842799  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1224  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  44.61 
 
 		 347 aa  269  5e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1229  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  43.41 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1833  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  44.31 
 
 		 347 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1912  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  43.43 
 
 		 342 aa  266  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5063  hypothetical protein  32.83 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1741  hypothetical protein  25.4 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2275  hypothetical protein  21.94 
 
 		 355 aa  79.3  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175878  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2226  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.69 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0683  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.22 
 
 		 265 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2599  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.83 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.597921 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2302  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.57 
 
 		 267 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2097  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.12 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.150498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1767  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.33 
 
 		 356 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6046  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.78 
 
 		 349 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.837371  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5816  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.78 
 
 		 349 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0125  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.06 
 
 		 324 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.554562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>