46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0278 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0278  protein of unknown function DUF123  100 
 
 		 125 aa  259  8.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0991873  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2572  hypothetical protein  56.6 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1038  hypothetical protein  51.4 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1123  hypothetical protein  52.25 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02280  hypothetical protein  39.66 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0578  protein of unknown function DUF123  37.5 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0654  protein of unknown function DUF123  44.33 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0625  hypothetical protein  34.21 
 
 		 119 aa  86.3  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0507  hypothetical protein  47.83 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0479  protein of unknown function DUF123  35.94 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1807  hypothetical protein  39.8 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0396  endonuclease III  38.39 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3196  protein of unknown function DUF123  40 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0858  hypothetical protein  37.39 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.29 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1312  hypothetical protein  32.8 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.474029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3380  protein of unknown function DUF123  36.97 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  36.44 
 
 		 356 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.39 
 
 		 356 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0198  hypothetical protein  34.75 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000406548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0067  hypothetical protein  39.29 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1462  protein of unknown function DUF123  37.29 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2461  hypothetical protein  39.67 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.34 
 
 		 356 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.9 
 
 		 357 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0747  hypothetical protein  32.76 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0646  hypothetical protein  36.75 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.269467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0898  protein of unknown function DUF123  40 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0253075  normal  0.780245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0776  protein of unknown function DUF123  42.86 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1232  hypothetical protein  39.32 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0815  hypothetical protein  34.48 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2695  hypothetical protein  37.29 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0042  hypothetical protein  37.72 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.899596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0051  hypothetical protein  40.54 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1958  hypothetical protein  35.71 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1962  hypothetical protein  36.17 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0414  protein of unknown function DUF123  36.94 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.434904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0265  hypothetical protein  29.31 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0984626  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1424  hypothetical protein  30.4 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1211  hypothetical protein  30.19 
 
 		 189 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.174889  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0267  hypothetical protein  26.72 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0194677  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0792  hypothetical protein  34.07 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0013461 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0871  hypothetical protein  35 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0937  protein of unknown function DUF123  36.07 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.305351  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1482  hypothetical protein  36.14 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0956236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0260  hypothetical protein  26.77 
 
 		 197 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0029368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>