29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0149 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0149  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  899    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04510  hypothetical protein  67.78 
 
 		 459 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0531552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4735  GTP-binding protein, HSR1-related  60.48 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.192614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0437  hypothetical protein  66.82 
 
 		 458 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48140  HSR1-related GTP-binding protein  63.39 
 
 		 447 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0331  GTP-binding protein HSR1-related  61.42 
 
 		 454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5363  GTP-binding protein, HSR1-like  62.04 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5186  GTP-binding protein HSR1-related  60.66 
 
 		 454 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5134  hypothetical protein  60.44 
 
 		 456 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0439  hypothetical protein  61.33 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5007  GTP-binding protein, HSR1-related  60.44 
 
 		 454 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4212  GTP-binding protein, HSR1-related  62.64 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0511  GTP-binding protein HSR1-related  62.08 
 
 		 462 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.886281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3226  GTP-binding protein HSR1-related  47.44 
 
 		 473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4059  GTP-binding protein HSR1-related  38.71 
 
 		 454 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3494  GTP-binding protein, HSR1-related  38.43 
 
 		 464 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000393129 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1298  GTP-binding protein, HSR1-related  42.33 
 
 		 538 aa  266  5e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1120  hypothetical protein  42.27 
 
 		 524 aa  260  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1205  GTP-binding protein, HSR1-related  42.57 
 
 		 520 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0950  GTP-binding protein, HSR1-related  27.25 
 
 		 467 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.892175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0080  hypothetical protein  27.49 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1450  GTP-binding protein HSR1-related  26.21 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2941  GTP-binding protein HSR1-related  32.39 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.781995 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0660  GTP-binding protein HSR1-related  27.84 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1439  hypothetical protein  33.71 
 
 		 514 aa  53.5  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  38.05 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0246  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  35.53 
 
 		 197 aa  45.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0886847  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0519  GTP-binding protein EngA  23.86 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0199  tRNA modification GTPase TrmE  38.46 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.649237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>