44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2852 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2852  putative integral membrane protein  100 
 
 
537 aa  1069    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4458  metallophosphoesterase  61.64 
 
 
514 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0545  metallophosphoesterase  53.91 
 
 
544 aa  481  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3363  metallophosphoesterase  47.54 
 
 
532 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9057  hypothetical protein  50.1 
 
 
499 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1115  metallophosphoesterase  45.04 
 
 
526 aa  360  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190762  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1223  metallophosphoesterase  44.72 
 
 
546 aa  359  8e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.148562  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4366  metallophosphoesterase  41.3 
 
 
489 aa  336  5.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4738  metallophosphoesterase  43.02 
 
 
513 aa  322  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.203482  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11330  predicted phosphohydrolase  38.45 
 
 
537 aa  265  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0868  metallophosphoesterase  37.65 
 
 
544 aa  262  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00146692  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1242  metallophosphoesterase  28.89 
 
 
499 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1472  metallophosphoesterase  26.28 
 
 
466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.114222  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2226  hypothetical protein  26.77 
 
 
489 aa  150  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1715  metallophosphoesterase  35 
 
 
577 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.942049  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2227  metallophosphoesterase  29.88 
 
 
699 aa  75.1  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13180  hypothetical protein  33.5 
 
 
635 aa  75.1  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0785963  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1571  metallophosphoesterase  29.86 
 
 
645 aa  64.3  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2238  metallophosphoesterase  31.16 
 
 
663 aa  60.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.771781  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1285  metallophosphoesterase  28.89 
 
 
474 aa  57.4  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.645339  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1743  metallophosphoesterase  25.35 
 
 
214 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.97747  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4019  metallophosphoesterase  27.62 
 
 
480 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3641  metallophosphoesterase  26.32 
 
 
217 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577036 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1218  metallophosphoesterase  23.32 
 
 
366 aa  47.4  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0970126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3441  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  32.26 
 
 
275 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02854  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4346  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  33.33 
 
 
275 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3536  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  32.26 
 
 
275 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3364  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  32.26 
 
 
275 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3369  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  32.26 
 
 
275 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3434  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  32.26 
 
 
275 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02904  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  33.33 
 
 
275 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3465  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  33.33 
 
 
275 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.481637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3327  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  33.33 
 
 
275 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal  0.654688 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0665  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  33.33 
 
 
274 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0159191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3210  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  33.33 
 
 
275 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.179691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3496  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  33.33 
 
 
275 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2890  metallophosphoesterase  29.31 
 
 
221 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0668  Calcineurin phosphoesterase domain protein  33.33 
 
 
275 aa  44.7  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0657  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
280 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.802143  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1132  cytoplasmic membrane protein  26.29 
 
 
370 aa  44.3  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00503148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44430  Metallophosphoesterase protein  27.62 
 
 
291 aa  43.9  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0281  cyclic 3',5'-adenosine monophosphate phosphodiesterase  30.77 
 
 
299 aa  43.9  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25470  predicted phosphohydrolase  30.95 
 
 
353 aa  43.9  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>