17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2210 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2210  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3419  regulatory protein, FmdB family  68.33 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0433  FmdB family regulatory protein  77.08 
 
 		 70 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.186737  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0648  regulatory protein, FmdB family  74.47 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6110  regulatory protein, FmdB family  69.81 
 
 		 69 aa  81.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2540  FmdB family regulatory protein  74.47 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29350  putative regulatory protein, FmdB family  64.71 
 
 		 67 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1341  regulatory protein, FmdB family  68.75 
 
 		 73 aa  78.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141907  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0363  FmdB family regulatory protein  75.51 
 
 		 70 aa  60.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0337  hypothetical protein  39.66 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1721  hypothetical protein  34.78 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.468781  normal  0.898434 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  36.36 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2441  FmdB transcriptional regulator  43.48 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  39.24 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  38.33 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1496  regulatory protein, FmdB family  42.55 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_640  hypothetical protein  38.6 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000170615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>