25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1251 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1251  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  318  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  45.1 
 
 
154 aa  127  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  44.2 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4139  hypothetical protein  42.36 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  47.15 
 
 
146 aa  114  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  43.38 
 
 
154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  41.43 
 
 
153 aa  110  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  42.07 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0734  hypothetical protein  45.19 
 
 
167 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02310  hypothetical protein  39.62 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1893  hypothetical protein  44.92 
 
 
323 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  36.24 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3857  hypothetical protein  40.17 
 
 
154 aa  87.4  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4611  hypothetical protein  39.57 
 
 
155 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  38.85 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  38.85 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3478  hypothetical protein  36.49 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1084  hypothetical protein  34.43 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116148  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1958  hypothetical protein  35.88 
 
 
155 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109021  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4766  hypothetical protein  50.85 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.836196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1353  hypothetical protein  28.57 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1470  hypothetical protein  26.85 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5079  hypothetical protein  30.14 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309387  normal  0.255994 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0838  hypothetical protein  34.56 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4032  hypothetical protein  38.16 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.205092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>