More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1100 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  100 
 
 		 328 aa  655    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  72.64 
 
 		 330 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  70.98 
 
 		 326 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.57 
 
 		 341 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  71.79 
 
 		 325 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  63.41 
 
 		 359 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.99 
 
 		 354 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  67.08 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  62.65 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  66.44 
 
 		 350 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  61.71 
 
 		 351 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  63.64 
 
 		 342 aa  388  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  70.07 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.95 
 
 		 339 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.62 
 
 		 335 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  61.24 
 
 		 372 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.13 
 
 		 332 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.95 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1405  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  67.49 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0567323  hitchhiker  0.00186052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  67.74 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1280  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60.19 
 
 		 383 aa  350  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000592788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  53.75 
 
 		 327 aa  341  9e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3272  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  62.66 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0220778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.04 
 
 		 314 aa  331  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.75 
 
 		 318 aa  328  9e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  53.75 
 
 		 323 aa  326  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  54.98 
 
 		 347 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  51.99 
 
 		 312 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.44 
 
 		 325 aa  322  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  50 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  53.24 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  52.88 
 
 		 314 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  52.88 
 
 		 331 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.59 
 
 		 319 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.34 
 
 		 313 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.73 
 
 		 315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2420  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.38 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  53.53 
 
 		 320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.49 
 
 		 320 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  48.37 
 
 		 318 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  49.49 
 
 		 320 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  49.83 
 
 		 305 aa  311  6.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50.17 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  50.34 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  49.19 
 
 		 317 aa  310  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  52.24 
 
 		 331 aa  308  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.68 
 
 		 327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  48.84 
 
 		 305 aa  305  7e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.32 
 
 		 313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  49.33 
 
 		 309 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4071  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  52.4 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.261708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1802  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.08 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.916735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  56.27 
 
 		 316 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  45.72 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 		 322 aa  299  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  54.58 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2775  ATPase  51.27 
 
 		 319 aa  299  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.63 
 
 		 321 aa  298  7e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4817  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.51 
 
 		 330 aa  297  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3212  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.49 
 
 		 322 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0307569  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 		 312 aa  294  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3802  ATPase  52.65 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136563  normal  0.371398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  51.69 
 
 		 331 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16660  MoxR-like ATPase  54.9 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.0126218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.14 
 
 		 309 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  46.2 
 
 		 310 aa  293  3e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0634  ATPase  53.51 
 
 		 324 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00000306223  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  47.87 
 
 		 310 aa  291  9e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  47.02 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27460  MoxR-like ATPase  53.94 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0049  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.03 
 
 		 319 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1331  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.85 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  51.89 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.77 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  51.01 
 
 		 313 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.82 
 
 		 306 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.04 
 
 		 314 aa  288  7e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49 
 
 		 302 aa  288  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 		 319 aa  288  8e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  47.81 
 
 		 296 aa  288  9e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  47.81 
 
 		 296 aa  288  9e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0460  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.09 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21600  MoxR-like ATPase  50.54 
 
 		 322 aa  287  2e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.264241  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4605  ATPase  51.2 
 
 		 323 aa  285  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.61 
 
 		 333 aa  285  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  46.89 
 
 		 316 aa  285  9e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  49.5 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.69 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.91 
 
 		 306 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.91 
 
 		 306 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  50.5 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  48.39 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  49.83 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.36 
 
 		 335 aa  279  4e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.78 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2537  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.17 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  53.08 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2197  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.68 
 
 		 318 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451133  decreased coverage  0.00303676 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0387  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.52 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>