22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3637 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3637  reverse transcriptase-like  100 
 
 		 48 aa  100  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  81.25 
 
 		 635 aa  85.5  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  79.17 
 
 		 634 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  81.25 
 
 		 635 aa  85.5  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1119  group II intron, maturase-specific  79.17 
 
 		 338 aa  84  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2438  group II intron, maturase-specific  79.17 
 
 		 338 aa  84  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  79.17 
 
 		 554 aa  83.6  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  70.83 
 
 		 589 aa  80.9  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  62.5 
 
 		 666 aa  67.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4520  reverse transcriptase-like  69.05 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  62.22 
 
 		 607 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  62.22 
 
 		 607 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  62.22 
 
 		 607 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  62.22 
 
 		 607 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  57.78 
 
 		 648 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  57.78 
 
 		 648 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  53.33 
 
 		 661 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  52.27 
 
 		 596 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  52.27 
 
 		 627 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  52.27 
 
 		 627 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  53.33 
 
 		 502 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  51.06 
 
 		 487 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>