26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2399 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2399  TM2 domain-containing protein  100 
 
 		 169 aa  346  9e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324538  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  35.4 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1825  TM2 domain containing protein  39.33 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4957  TM2  35.53 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0479  TM2 domain-containing protein  52.46 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5043  hypothetical protein  42.86 
 
 		 184 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307475  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5141  TM2 domain-containing protein  44.16 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4964  TM2 domain-containing protein  47.22 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0480  TM2  44.74 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05210  hypothetical protein  48 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0374  TM2 domain-containing protein  44.16 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03100  TM2 domain-containing hypothetical protein  47.3 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0498  hypothetical protein  48 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5091  hypothetical protein  47.22 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2502  TM2  49.25 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000265771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1993  TM2 domain-containing protein  44.87 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0383529  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5316  TM2  47.44 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4145  TM2 domain-containing protein  48.61 
 
 		 132 aa  62  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0167  TM2 domain-containing protein  47.89 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0299  TM2 domain containing protein  43.66 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000251621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1622  hypothetical protein  42.25 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4699  hypothetical protein  40.24 
 
 		 111 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53630  hypothetical protein  40.24 
 
 		 111 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142273  hitchhiker  0.000532666 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  40.51 
 
 		 117 aa  45.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1791  TM2  36.71 
 
 		 124 aa  42.7  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0956269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2261  TM2 domain-containing protein  25.25 
 
 		 103 aa  41.6  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46379  normal  0.197019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>