More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1958 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1958  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
170 aa  355  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0491085  hitchhiker  0.00899541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3952  ferric uptake regulator, Fur family  72.73 
 
 
177 aa  246  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  76.67 
 
 
151 aa  244  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0564  ferric uptake regulator  76 
 
 
151 aa  242  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  73.51 
 
 
151 aa  240  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3404  ferric uptake regulator family protein  64.81 
 
 
174 aa  233  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.092554  normal  0.327657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0870  ferric uptake regulator, Fur family  70.41 
 
 
169 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0896  ferric uptake regulator, Fur family  70.41 
 
 
169 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000149123  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  74.64 
 
 
147 aa  216  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  44.2 
 
 
148 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  44.96 
 
 
150 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  41.18 
 
 
154 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  43.41 
 
 
150 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  43.41 
 
 
150 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  43.41 
 
 
150 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07001  ferric uptake regulator family protein  42.75 
 
 
143 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0209563  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  38.51 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0869  ferric uptake regulator family protein  41.61 
 
 
151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1775  ferric uptake regulator family protein  38.69 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.103697  normal  0.0302993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2170  ferric uptake regulator family protein  38.52 
 
 
149 aa  100  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.414225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  37.21 
 
 
154 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  36.09 
 
 
143 aa  90.9  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 
149 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  30.77 
 
 
149 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  35.46 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  31.69 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  32.14 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  35.29 
 
 
152 aa  89.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  34.81 
 
 
150 aa  88.2  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  34.56 
 
 
152 aa  88.2  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  36.45 
 
 
146 aa  87.4  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  35.82 
 
 
153 aa  87  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  35.07 
 
 
143 aa  86.3  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  35.43 
 
 
144 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  37.98 
 
 
148 aa  85.5  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  37.88 
 
 
148 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  37.88 
 
 
148 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  37.88 
 
 
148 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  37.88 
 
 
148 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  40.19 
 
 
155 aa  85.5  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  31.34 
 
 
151 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  37.88 
 
 
150 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  37.88 
 
 
148 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  37.88 
 
 
148 aa  85.1  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  37.88 
 
 
150 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  37.88 
 
 
150 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  37.88 
 
 
148 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  37.88 
 
 
150 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  37.88 
 
 
150 aa  85.1  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  37.88 
 
 
148 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  31.34 
 
 
151 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  37.88 
 
 
148 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  38.3 
 
 
147 aa  84.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  31.34 
 
 
151 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
151 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
151 aa  84.7  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
151 aa  84.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
151 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  31.34 
 
 
151 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
151 aa  84.7  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  37.98 
 
 
148 aa  84.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  31.34 
 
 
151 aa  84.3  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  33.57 
 
 
138 aa  84.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  37.98 
 
 
148 aa  84.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  37.12 
 
 
149 aa  84.3  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  37.12 
 
 
149 aa  84  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  36.09 
 
 
143 aa  84.3  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  35 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1389  ferric uptake regulation protein  35 
 
 
145 aa  84  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000000498211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1147  ferric uptake regulator family protein  35.17 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  36.09 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  30.6 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  35.71 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  32.31 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  41.82 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  36.36 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  36.43 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  31.39 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  35.43 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  36.09 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  37.1 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  35.61 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2029  FUR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  37.21 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  34.33 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1567  ferric uptake regulator, Fur family  37.76 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1746  FUR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  33.59 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  36.43 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  36.15 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  36.43 
 
 
143 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  36.43 
 
 
143 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  36.43 
 
 
143 aa  79  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0013  ferric-uptake regulator  32.59 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0292053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  36.43 
 
 
143 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  36.43 
 
 
143 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0223  transcriptional regulator  36.43 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  34.35 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>