63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4050 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  100 
 
 
331 aa  654    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1404  membrane protein-like protein  62.54 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2502  putative integral membrane protein  57.7 
 
 
331 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1334  hypothetical protein  55.02 
 
 
330 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5458  hypothetical protein  55.02 
 
 
330 aa  361  9e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5230  hypothetical protein  58.36 
 
 
330 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.753806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4951  hypothetical protein  58.36 
 
 
330 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4862  hypothetical protein  58.36 
 
 
330 aa  347  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3912  integral membrane protein  55.14 
 
 
331 aa  343  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00542014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3752  protein of unknown function DUF95 transmembrane  58.98 
 
 
334 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  53.4 
 
 
336 aa  322  6e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3829  protein of unknown function DUF95 transmembrane  52.69 
 
 
332 aa  321  8e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157843  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5852  hypothetical protein  51.04 
 
 
336 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  48.92 
 
 
331 aa  316  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13725  transmembrane protein  52.58 
 
 
330 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258744  normal  0.61477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7600  protein of unknown function DUF95 transmembrane  49.85 
 
 
333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0773481  normal  0.0891448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09270  uncharacterized membrane protein  51.4 
 
 
329 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.130747 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2521  protein of unknown function DUF95 transmembrane  51.7 
 
 
329 aa  298  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.626612  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  48.96 
 
 
337 aa  282  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2338  protein of unknown function DUF95 transmembrane  51.71 
 
 
329 aa  276  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00579329  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1202  integral membrane protein  44.86 
 
 
328 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1835  protein of unknown function DUF95 transmembrane  47.66 
 
 
328 aa  263  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.920974  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  46.73 
 
 
331 aa  256  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1272  protein of unknown function DUF95 transmembrane  43.85 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000243278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  30.15 
 
 
322 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.56 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4440  integral membrane protein  29.15 
 
 
325 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.627062  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1082  hypothetical protein  29.66 
 
 
335 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09283  hypothetical protein  26.21 
 
 
324 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  28.62 
 
 
321 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4267  hypothetical protein  28.92 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000574123  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3128  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.48 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3743  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.95 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3215  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.63 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0604768  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0410  hypothetical protein  26.62 
 
 
342 aa  92.8  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65934  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38340  hypothetical protein  29.09 
 
 
325 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4888  hypothetical protein  27.18 
 
 
326 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.32174  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.99 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56110  hypothetical protein  25.68 
 
 
326 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3844  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.48 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2967  hypothetical protein  28.39 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal  0.0170262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2676  hypothetical protein  29.32 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  24.09 
 
 
603 aa  80.1  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3317  hypothetical protein  27.74 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.945777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4022  integral membrane protein  26.93 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96338  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.77 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0462  hypothetical protein  28.26 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2232  hypothetical protein  22.68 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.36 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4318  integral membrane protein  27.24 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.01 
 
 
211 aa  63.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1683  protein of unknown function DUF95 transmembrane  35.71 
 
 
327 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1030  hypothetical protein  31.58 
 
 
215 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1639  hypothetical protein  32.81 
 
 
193 aa  52.8  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0289  integral membrane protein  34.4 
 
 
246 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271645  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1756  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.73 
 
 
197 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000547169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0946  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.95 
 
 
188 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.886954  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1789  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.59 
 
 
754 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.482085 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0535  hypothetical protein  33.04 
 
 
160 aa  47  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1962  hypothetical protein  25.15 
 
 
197 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.923141 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.28 
 
 
509 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1427  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.25 
 
 
511 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0346  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.36 
 
 
528 aa  42.7  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.160239 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>