14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3590 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3590  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  882    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.532709  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1926  membrane protein  40.45 
 
 
1197 aa  272  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.759064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7658  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  39.49 
 
 
719 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0437  polysaccharide biosynthesis protein  31.87 
 
 
433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1584  hypothetical protein  30.37 
 
 
420 aa  126  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  26.03 
 
 
441 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 
440 aa  82.8  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 
1297 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.36707  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0210  hypothetical protein  27.81 
 
 
451 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5089  hypothetical protein  26.58 
 
 
408 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2389  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0674  polysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 
413 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6397  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 
612 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6732  polysaccharide biosynthesis protein  29.47 
 
 
459 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>