19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2780 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2780  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 340 aa  684    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0168913  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4143  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  49.21 
 
 		 318 aa  295  7e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3550  cyclase/dehydrase  47.62 
 
 		 316 aa  286  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1222  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  48.39 
 
 		 314 aa  285  9e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.521023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2197  cyclase/dehydrase  50.16 
 
 		 319 aa  279  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4098  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  46.51 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4151  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  37.25 
 
 		 315 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6488  actinorhodin polyketide synthase bifunctional cyclase/dehydratase  34.83 
 
 		 330 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1429  cyclase/dehydrase  30.37 
 
 		 150 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0355733 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2787  hypothetical protein  30.37 
 
 		 150 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104721  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4733  cyclase/dehydrase  25.25 
 
 		 144 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.476738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1045  cyclase/dehydrase  29.63 
 
 		 150 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.447499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4598  cyclase/dehydrase  25.25 
 
 		 144 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762203  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4732  cyclase/dehydrase  25.25 
 
 		 182 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22786  normal  0.0214019 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43040  hypothetical protein  28.12 
 
 		 144 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0700  cyclase/dehydrase  23.23 
 
 		 144 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220634  hitchhiker  0.0000821406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4201  cyclase/dehydrase  25.25 
 
 		 144 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4513  hypothetical protein  25.25 
 
 		 157 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.334417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0757  cyclase/dehydrase  24.24 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>