228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1601 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1601  AAA ATPase  100 
 
 
335 aa  675    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2074  ATPase  50 
 
 
324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1732  ATPase-like protein  49.84 
 
 
350 aa  308  8e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0797169  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0437  AAA ATPase  50.15 
 
 
332 aa  301  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.493409  normal  0.191273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2133  ATPase-like protein  47.52 
 
 
315 aa  300  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170548  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3104  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.58 
 
 
343 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6955  AAA ATPase  48.04 
 
 
373 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4307  ATPase  43.9 
 
 
364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0507222  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2229  ATPase  43.43 
 
 
381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3882  AAA ATPase  45.18 
 
 
372 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.50535  normal  0.019718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4517  AAA ATPase central domain protein  40.38 
 
 
392 aa  229  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.460777 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0402  ATPase  43.82 
 
 
385 aa  206  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.447843  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2767  ATPase  40.68 
 
 
311 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313404  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5020  AAA ATPase central domain protein  44.5 
 
 
278 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.422648  normal  0.019419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4631  ATPase central domain-containing protein  39.65 
 
 
283 aa  155  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5094  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.65 
 
 
283 aa  155  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4254  ATPase protein  47 
 
 
288 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5168  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.65 
 
 
283 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2134  ATPase  35.09 
 
 
291 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00244059  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02167  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  35.92 
 
 
278 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0108  ATPase  37.83 
 
 
292 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0213616  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1170  AAA family ATPase  43.32 
 
 
280 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0809  ATPase  36.4 
 
 
284 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652104  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1178  AAA family ATPase  43.32 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1940  ATPase central domain-containing protein  37.54 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0802  AAA family ATPase  36.26 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0965  ATPase, AAA family protein  41.38 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7091  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.77 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4638  ATPase  44.09 
 
 
281 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.10339 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2682  AAA_5 ATPase  40.26 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0320361  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0299  ATPase, AAA family protein  42.86 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1016  ATPase, AAA family protein  42.86 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1331  ATPase, AAA family protein  41.38 
 
 
317 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00666024  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2516  ATPase  34.15 
 
 
278 aa  146  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.352302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2122  ATPase  42.92 
 
 
280 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787616  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0986  ATPase  34.58 
 
 
292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1936  ATPase, AAA family protein  39.29 
 
 
317 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6213  ATPase  37.19 
 
 
281 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2371  ATPase  39.92 
 
 
280 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0849  ATPase, AAA family protein  39.29 
 
 
317 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1023  AAA ATPase, central region:ATPase  35.69 
 
 
295 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58673  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1719  ATPase central domain-containing protein  34.55 
 
 
290 aa  144  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631647  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2251  ATPase  39.92 
 
 
280 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.24 
 
 
280 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62341 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2355  ATPase central domain-containing protein  40.08 
 
 
286 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0906  ATPase  34.48 
 
 
289 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.166593  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1720  ATPase  40.08 
 
 
286 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.501312  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2332  ATPase  40.08 
 
 
286 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6260  ATPase  42.01 
 
 
280 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1222  ATPase  37.76 
 
 
286 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3462  ATPase  42.47 
 
 
280 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0889695  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3315  putative ATPase, AAA family protein  37.82 
 
 
280 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492501  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0945  ATPase  39.66 
 
 
280 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5674  AAA ATPase  39.66 
 
 
280 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1977  ATPase  40.83 
 
 
294 aa  142  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3298  hypothetical protein  40.64 
 
 
281 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0864  AAA ATPase central domain protein  34.33 
 
 
297 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125814  normal  0.499704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4467  AAA ATPase central domain protein  36.88 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179152  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1910  ATPase  39.92 
 
 
280 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102293  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1385  AAA ATPase central domain protein  35.52 
 
 
283 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4138  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.01 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18588  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1430  ATPase  35.54 
 
 
345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2101  ATPase  40.09 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2058  ATPase  37.9 
 
 
277 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3608  AAA ATPase central domain protein  35.29 
 
 
289 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1408  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.21 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1883  putative clpA/clpB family protein  41.55 
 
 
280 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406023  normal  0.307774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2894  ATPase  39.45 
 
 
289 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220244  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0998  hypothetical protein  39.91 
 
 
290 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451965  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3155  ATPase  36.92 
 
 
284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.56 
 
 
282 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3556  ATPase central domain-containing protein  39.27 
 
 
280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.187416  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0517  AAA ATPase, central region:ATPase  33.11 
 
 
301 aa  140  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2090  ATPase AAA_5  35.71 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0794647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1094  ATPase, AAA family protein  38.17 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0929  AAA ATPase central domain protein  32.89 
 
 
293 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  0.607082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2541  ATPase  38.81 
 
 
281 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104036  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1191  ATPase  41.36 
 
 
279 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.81 
 
 
280 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2357  ATPase  34.29 
 
 
284 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.797893  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2653  AAA family ATPase  41.36 
 
 
279 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1639  ATPase  39.73 
 
 
281 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.435495  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0548  ATPase  37.69 
 
 
279 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2505  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.29 
 
 
315 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3952  ATPase central domain-containing protein  41.82 
 
 
284 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1311  ATPase  41.36 
 
 
279 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29130  ATPase  34.04 
 
 
281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1605  ATPase central domain-containing protein  33.45 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.863754  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1788  ATPase  34.04 
 
 
281 aa  137  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2638  ATPase  38.24 
 
 
281 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858309  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0860  ATPase  36.02 
 
 
280 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3984  hypothetical protein  34.04 
 
 
281 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0894  ATPase  37.9 
 
 
279 aa  135  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1661  ATPase  39.46 
 
 
284 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1409  ATPase  31.91 
 
 
281 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1589  AAA_5 ATPase  37.08 
 
 
284 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.566046  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1580  AAA ATPase, central region:AAA ATPase, central region  31.91 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.261649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3873  ATPase  36.41 
 
 
281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0352016  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32860  ATPase, AAA family protein  38.08 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4094  ATPase  32.03 
 
 
281 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.271648  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>