14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1421 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1421  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  322  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0816911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0738  hypothetical protein  50.31 
 
 
164 aa  154  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0481  hypothetical protein  46.99 
 
 
164 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3776  hypothetical protein  39.88 
 
 
166 aa  117  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0790656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0786  hypothetical protein  57.14 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7413  hypothetical protein  25.17 
 
 
966 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38108  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05950  hypothetical protein  27.56 
 
 
670 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.846681  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8487  hypothetical protein  29.58 
 
 
5128 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0936  hypothetical protein  31.91 
 
 
3677 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1215  hypothetical protein  39.06 
 
 
1275 aa  44.3  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0816157  normal  0.554588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1217  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.06 
 
 
7422 aa  44.3  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.446236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2525  hypothetical protein  36.11 
 
 
2247 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00422274 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1435  hypothetical protein  28.05 
 
 
3437 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0503508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8529  hypothetical protein  28.33 
 
 
1939 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667602  normal  0.0232783 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>