12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3776 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3776  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  323  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0790656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0738  hypothetical protein  47.53 
 
 		 164 aa  147  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428858  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0481  hypothetical protein  48.15 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1421  hypothetical protein  39.88 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0816911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0786  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0936  hypothetical protein  32.14 
 
 		 3677 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7413  hypothetical protein  25.35 
 
 		 966 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38108  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0475  hypothetical protein  57.75 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1217  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.37 
 
 		 7422 aa  44.7  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.446236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2525  hypothetical protein  35.42 
 
 		 2247 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1215  hypothetical protein  40.85 
 
 		 1275 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0816157  normal  0.554588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1435  hypothetical protein  27.39 
 
 		 3437 aa  41.2  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0503508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>