34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0250 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0250  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  633    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0245  hypothetical protein  63.33 
 
 
346 aa  292  6e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  52.7 
 
 
345 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2309  hypothetical protein  39.22 
 
 
206 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1736  hypothetical protein  37.25 
 
 
205 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.679061 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1722  hypothetical protein  37.25 
 
 
205 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2135  hypothetical protein  38.56 
 
 
206 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2268  shikimate kinase  38.56 
 
 
206 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.597105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2079  hypothetical protein  38.56 
 
 
206 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1644  hypothetical protein  37.65 
 
 
248 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1644  hypothetical protein  36.6 
 
 
205 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1537  hypothetical protein  39.22 
 
 
205 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1993  P-loop ATPase protein  35.95 
 
 
205 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5015  hypothetical protein  37.84 
 
 
201 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.549407  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0819  putative ATP-ase  34.38 
 
 
192 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2638  putative ATP-ase  33.75 
 
 
192 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3695  hypothetical protein  37.43 
 
 
186 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  29.38 
 
 
197 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2267  P-loop ATPase protein  34.64 
 
 
205 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0720  putative ATP-ase  32.48 
 
 
198 aa  85.9  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6356  hypothetical protein  37.9 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0977  hypothetical protein  37.8 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.518817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2639  P-loop ATPase  28.74 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.291525 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1242  hypothetical protein  32.03 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0512  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
401 aa  79  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4819  hypothetical protein  29.34 
 
 
202 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0904  hypothetical protein  29.83 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0586  hypothetical protein  29.1 
 
 
197 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883676  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2634  hypothetical protein  25.81 
 
 
190 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2484  hypothetical protein  27.84 
 
 
212 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  29.81 
 
 
518 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  36.84 
 
 
579 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0316  hypothetical protein  36.36 
 
 
90 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  33.02 
 
 
173 aa  42.7  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.367363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>