115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_R0008 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_R0008  tRNA-Tyr  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0008  tRNA-Tyr  95.29 
 
 		 85 bp  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0011  tRNA-Tyr  95.35 
 
 		 86 bp  131  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0070  tRNA-Tyr  93.83 
 
 		 85 bp  121  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0014  tRNA-Tyr  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0049  tRNA-Tyr  90.59 
 
 		 85 bp  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0055  tRNA-Tyr  89.53 
 
 		 86 bp  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0006  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 86 bp  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0005  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 86 bp  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.1889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0005  tRNA-Tyr  89.41 
 
 		 86 bp  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.998784  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0009  tRNA-Tyr  89.16 
 
 		 83 bp  85.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0065  tRNA-Tyr  87.8 
 
 		 82 bp  83.8  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0649781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0054  tRNA-Tyr  89.71 
 
 		 82 bp  79.8  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0012  tRNA-Tyr  89.39 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0012  tRNA-Tyr  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0013  tRNA-Tyr  93.48 
 
 		 81 bp  67.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167432  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21340  tRNA-Tyr  86.05 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0704715  hitchhiker  0.000101375 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14005  tRNA-Tyr  85.88 
 
 		 84 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.844659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0053  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 83 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0010  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000639751  normal  0.164042 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0008  tRNA-Tyr  85.71 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0051  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0652874  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0016  tRNA-Tyr  92.31 
 
 		 85 bp  54  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.972544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0010  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0010  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.112796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0074  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727456  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0008  tRNA-Tyr  90.48 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323474  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0047  tRNA-Tyr  91.89 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0012  tRNA-Tyr  86.79 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0787862  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03440  tRNA-Tyr  86.79 
 
 		 82 bp  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.736361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0047  tRNA-Tyr  84.62 
 
 		 85 bp  50.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000031585  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0013  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000469327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0043  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000118909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0016  tRNA-Tyr  84.38 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0163881 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0024  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000291994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0013  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000223303  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0017  tRNA-Tyr  84.38 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411262  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4565  tRNA-Tyr  84.38 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795414  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0016  tRNA-Tyr  84.38 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0047  tRNA-Tyr  93.75 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0005  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000002791  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0074  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.700319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0075  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0076  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tTyr01  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0010  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0067  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.439921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0068  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.314206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0069  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.304114  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t04  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t05  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_t06  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0048  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0049  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0050  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.399527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0132  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000516023  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0007  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171771  normal  0.0302346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0071  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.676805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0072  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.926918 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0073  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.92183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0054  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.329016  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0055  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0056  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0126  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000000986876  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0012  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000467845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0056  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.153406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0057  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172076  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0058  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.17611  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1874  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0618202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0014  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000039467  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0113  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.532695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0114  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.524989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0115  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.542258  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0116  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.427011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0117  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.439512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0014  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000873726  hitchhiker  0.00049281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0066  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.119149  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0067  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.11453  normal  0.549704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0068  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112006  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0315  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0069  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.548705  normal  0.0555108 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0070  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.531794  normal  0.0573662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0071  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.719638  normal  0.0567471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0072  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554165  normal  0.0570473 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0155  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720201  hitchhiker  0.000109312 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t006  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000887423  normal  0.123776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t074  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00586158  normal  0.155604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t076  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00524716  normal  0.153954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t077  tRNA-Tyr  84.13 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00521394  normal  0.158484 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0014  tRNA-Tyr  89.74 
 
 		 82 bp  46.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526877  normal  0.0596738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0006  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000157538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0033  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90982  normal  0.487146 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0434  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0435  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000139864  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2720  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000267596  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00236  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01440  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01441  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01442  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01443  tRNA-Tyr  93.33 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>