27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3280 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3280  abortive infection protein  100 
 
 
233 aa  442  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4587  protease, CAAX amino terminal family  51.35 
 
 
240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000987036  normal  0.0574334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3583  abortive infection protein  50.27 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3247  Abortive infection protein  34.73 
 
 
264 aa  87  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0291  Abortive infection protein  39.85 
 
 
567 aa  85.9  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.621613  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2732  CAAX amino protease  25.33 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0004  abortive infection protein  33.8 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00759738  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1496  abortive infection protein  40.59 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.814681  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0605  caax amino protease family protein  34.94 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.364095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3509  Abortive infection protein  38.24 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217976  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2597  Abortive infection protein  38.24 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0859  Abortive infection protein  38.04 
 
 
375 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2922  abortive infection protein  37.78 
 
 
195 aa  45.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3240  abortive infection protein  33.33 
 
 
255 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.11341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  27.74 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  27.86 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  33 
 
 
340 aa  43.1  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2821  Abortive infection protein  31.96 
 
 
340 aa  43.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  27.86 
 
 
249 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0340  hypothetical protein  32.67 
 
 
193 aa  42.4  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53958  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  31.76 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  31.76 
 
 
249 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  31.76 
 
 
249 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  31.76 
 
 
235 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  31.76 
 
 
249 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  31.76 
 
 
249 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0616  Abortive infection protein  29.38 
 
 
196 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>