18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2695 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2695  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  511  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.452372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7767  hypothetical protein  49.41 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  38.49 
 
 
262 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  30.97 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  31.11 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  28.5 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  34.11 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  25.87 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  27 
 
 
265 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  29.33 
 
 
274 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  32.14 
 
 
429 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1050  hypothetical protein  25.91 
 
 
288 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  33.1 
 
 
734 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  30 
 
 
467 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  29 
 
 
700 aa  42.4  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  50 
 
 
263 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  34.91 
 
 
263 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2685  NERD domain-containing protein  24.84 
 
 
255 aa  42  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00601782  normal  0.186015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>