54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2436 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  100 
 
 		 157 aa  307  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  65.81 
 
 		 155 aa  210  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  30.77 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  28.21 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  26.28 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  26.92 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  28.21 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  28.21 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  27.56 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  26.92 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  28.21 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  26.92 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  25.64 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  30.99 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  24.84 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  24.52 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  30.46 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  30.46 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  23.49 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  26.35 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  27.92 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  25.87 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  25.42 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  29.68 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  25.56 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  26.03 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  26.71 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  25.17 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  23.94 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  25.17 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  26.57 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  25.17 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  23.78 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  25.68 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  25 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  23.61 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  22.97 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  22.92 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  20 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  26.45 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  23.03 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 300 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  22.75 
 
 		 177 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  21.95 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  24.51 
 
 		 300 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 300 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 300 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 300 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 300 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  24.51 
 
 		 300 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 300 aa  41.2  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  29.85 
 
 		 288 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 		 300 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  33.06 
 
 		 288 aa  40.8  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>