31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0470 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  238  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  86.67 
 
 
120 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  78.33 
 
 
120 aa  186  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  77.12 
 
 
146 aa  183  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  76.67 
 
 
120 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  77.5 
 
 
120 aa  176  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  78.33 
 
 
129 aa  176  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  64.71 
 
 
127 aa  159  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0309  peroxiredoxins-like protein  66.67 
 
 
124 aa  146  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0372  peroxiredoxins-like protein  66.67 
 
 
124 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  65 
 
 
118 aa  134  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  35.4 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  34.23 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  31.25 
 
 
121 aa  60.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0441  hypothetical protein  41.03 
 
 
119 aa  60.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.64264  normal  0.450906 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  34.71 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  32.48 
 
 
122 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  36.36 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  30.83 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  28.81 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  28.44 
 
 
120 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  28.81 
 
 
123 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  32.65 
 
 
192 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0512  DsrE family protein  28 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000160169  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  28.57 
 
 
272 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1774  DsrE family protein  32.04 
 
 
271 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1037  DsrE family protein  31.07 
 
 
271 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0964  DsrE family protein  26.5 
 
 
118 aa  42.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.622428  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  33.33 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0907  DsrE family protein  32.69 
 
 
271 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.386859  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  25.23 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>