26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0455 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0455  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  435  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184475  normal  0.579054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0897  hypothetical protein  45.29 
 
 
226 aa  184  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0597  hypothetical protein  35.4 
 
 
232 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2720  hypothetical protein  33.01 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.025893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4353  hypothetical protein  32.35 
 
 
232 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442825  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0945  hypothetical protein  32.37 
 
 
389 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.085357  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8249  hypothetical protein  30.57 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3730  hypothetical protein  30.13 
 
 
366 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0339  hypothetical protein  32.14 
 
 
262 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5596  hypothetical protein  27.8 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00840265  normal  0.0208396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4644  hypothetical protein  32.54 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3896  hypothetical protein  30.96 
 
 
405 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6172  hypothetical protein  27.07 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0295  hypothetical protein  31.67 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  28.04 
 
 
583 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2023  hypothetical protein  31.02 
 
 
259 aa  59.3  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37680  hypothetical protein  25.21 
 
 
270 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0858561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6825  hypothetical protein  30 
 
 
268 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0849  hypothetical protein  26.6 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3946  hypothetical protein  29.17 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.125264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6370  hypothetical protein  25.22 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2361  hypothetical protein  26.21 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0463376  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4985  hypothetical protein  28.38 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1649  hypothetical protein  35.48 
 
 
265 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0173  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0126  hypothetical protein  25.64 
 
 
227 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5098  hypothetical protein  34.18 
 
 
265 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>