20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2498 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2498  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  713    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0101  hypothetical protein  49.86 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.867237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0709  hypothetical protein  48.59 
 
 		 372 aa  298  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0595  hypothetical protein  39.08 
 
 		 370 aa  220  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3101  hypothetical protein  39.78 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2550  hypothetical protein  38.24 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0136518 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1427  hypothetical protein  41.09 
 
 		 367 aa  203  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.617063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1212  hypothetical protein  35.01 
 
 		 378 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3571  hypothetical protein  40.37 
 
 		 337 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.487226 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01319  hypothetical protein  34.37 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436322  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1539  hypothetical protein  36.08 
 
 		 377 aa  178  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2446  hypothetical protein  37.46 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.011853  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1372  hypothetical protein  35.65 
 
 		 338 aa  133  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.119661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4505  hypothetical protein  29.86 
 
 		 377 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2515  hypothetical protein  22.22 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  26.35 
 
 		 424 aa  55.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3377  hypothetical protein  25.39 
 
 		 363 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.718952  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  25.78 
 
 		 422 aa  49.7  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3822  hypothetical protein  24.38 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333872  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  29.44 
 
 		 393 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>