22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2497 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2497  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  100 
 
 
309 aa  633  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2549  HPr kinase  51.32 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0304295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0708  HPr kinase  50 
 
 
305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0102  HPr kinase  46.6 
 
 
301 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.263394  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1540  HPr kinase  51.77 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3100  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  45.79 
 
 
293 aa  258  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325175  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1211  HPr kinase  43.1 
 
 
303 aa  252  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0594  HPr kinase  40.92 
 
 
307 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.276169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2445  HPr kinase  38.78 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00295018  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1428  hypothetical protein  38.55 
 
 
285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01318  HPr kinase  40.8 
 
 
203 aa  162  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.362805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3572  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  33.93 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1373  HPr kinase  34.88 
 
 
330 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401214  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2816  HPr kinase  30.26 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4105  hypothetical protein  26.29 
 
 
404 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1464  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  51.85 
 
 
300 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26991  hypothetical protein  42.86 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0056  HPr kinase  38.81 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0215  HPr kinase  29.94 
 
 
366 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.623305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1585  HPr kinase  30.82 
 
 
326 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0820  Hpr(Ser) kinase/phosphatase  32.84 
 
 
301 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2552  HPr kinase  28 
 
 
339 aa  42.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>