More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2409 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2409  glutathione synthase  100 
 
 		 314 aa  630  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0220  glutathione synthetase  55.95 
 
 		 323 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0201  glutathione synthetase  55.95 
 
 		 323 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137628  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0345  glutathione synthetase  54.98 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.791895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0010  glutathione synthetase  58.18 
 
 		 339 aa  342  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163572  normal  0.0543888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0180  glutathione synthetase  56.87 
 
 		 316 aa  341  8e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0294  glutathione synthetase  55.95 
 
 		 317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2517  glutathione synthase  54.78 
 
 		 315 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0243  glutathione synthetase  55.95 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3736  glutathione synthetase  55.45 
 
 		 317 aa  335  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal  0.0329073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3909  glutathione synthetase  57.19 
 
 		 315 aa  335  7e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0926  glutathione synthetase  55.13 
 
 		 318 aa  334  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0765  glutathione synthetase  54.81 
 
 		 315 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.932033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5994  glutathione synthetase  52.56 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000842498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0574  glutathione synthetase  55.91 
 
 		 318 aa  326  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.918969  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3256  glutathione synthetase  54.49 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0915852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3907  glutathione synthetase  54.49 
 
 		 316 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0225291  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0217  glutathione synthetase  52.85 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0432  glutathione synthetase  53.18 
 
 		 317 aa  318  7.999999999999999e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.753162  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3214  glutathione synthetase  51.74 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2831  glutathione synthetase  51.74 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0655  glutathione synthetase  51.74 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0490  glutathione synthetase  51.74 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0188  glutathione synthetase  51.74 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582135  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1404  glutathione synthetase  51.74 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0410  glutathione synthetase  51.74 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197255  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0471  glutathione synthetase  51.74 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2780  glutathione synthetase  52.22 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2918  glutathione synthetase  51.9 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0528  glutathione synthetase  50.95 
 
 		 318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0440  glutathione synthetase  52.22 
 
 		 318 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4539  glutathione synthetase  51.27 
 
 		 316 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6192  glutathione synthetase  52.22 
 
 		 318 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2874  glutathione synthetase  51.9 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376119  normal  0.235828 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0259  glutathione synthetase  50.47 
 
 		 318 aa  309  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4540  glutathione synthetase  51.42 
 
 		 318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2249  glutathione synthetase  51.58 
 
 		 318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2863  glutathione synthetase  51.58 
 
 		 318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4187  glutathione synthetase  51.9 
 
 		 318 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2905  glutathione synthetase  51.64 
 
 		 310 aa  301  8.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4993  glutathione synthetase  49.84 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4867  glutathione synthetase  49.52 
 
 		 317 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522949  normal  0.0172859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0471  glutathione synthetase  50.16 
 
 		 317 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5043  glutathione synthetase  49.52 
 
 		 317 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03170  glutathione synthetase  50.32 
 
 		 318 aa  298  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.358999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1825  glutathione synthetase  47.92 
 
 		 321 aa  298  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0507  glutathione synthetase  50.97 
 
 		 317 aa  296  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002462  glutathione synthetase  47.62 
 
 		 316 aa  295  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2338  glutathione synthetase  48.25 
 
 		 322 aa  295  6e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1954  glutathione synthetase  48.23 
 
 		 313 aa  294  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.280823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05310  glutathione synthetase  50.65 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3635  glutathione synthase  47.21 
 
 		 317 aa  293  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.404738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03573  glutathione synthetase  46.98 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0020  glutathione synthetase  47.42 
 
 		 318 aa  289  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0487  glutathione synthetase  49.03 
 
 		 319 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0522  glutathione synthetase  45.48 
 
 		 325 aa  286  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0973461  hitchhiker  0.0017539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5309  glutathione synthetase  47.71 
 
 		 316 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.107271  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2975  glutathione synthetase  46.33 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0354  glutathione synthase  48.87 
 
 		 314 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.771377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4026  glutathione synthetase  48.39 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0220005  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0402  glutathione synthetase  48.39 
 
 		 318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0599  glutathione synthetase  47.42 
 
 		 317 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625296  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0545  glutathione synthetase  46.98 
 
 		 317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0301988  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5035  glutathione synthetase  48.06 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0838  glutathione synthetase  47.91 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.014661  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0831  glutathione synthetase  46.93 
 
 		 315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4135  glutathione synthetase  46.28 
 
 		 316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0836  glutathione synthetase  47.59 
 
 		 319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0502  glutathione synthetase  47.59 
 
 		 317 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3527  glutathione synthetase  46.93 
 
 		 317 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.182234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0833  glutathione synthetase  46.6 
 
 		 317 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000643207  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3342  glutathione synthetase  47.59 
 
 		 319 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0808  glutathione synthetase  46.6 
 
 		 317 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000233048  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2033  glutathione synthetase  45.16 
 
 		 327 aa  281  8.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0548  glutathione synthetase  47.42 
 
 		 328 aa  281  9e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3445  glutathione synthetase  46.6 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00475797 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1287  glutathione synthetase  46.3 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1752  glutathione synthetase  45.16 
 
 		 327 aa  281  1e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.925359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0689  glutathione synthetase  46.6 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00688489  normal  0.665368 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03292  glutathione synthetase  45.9 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0057  glutathione synthase  48.06 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3333  glutathione synthetase  46.6 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0352151  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3162  glutathione synthetase  46.28 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00627108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0840  glutathione synthetase  46.28 
 
 		 317 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00539981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0542  glutathione synthetase  46.28 
 
 		 317 aa  279  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1810  glutathione synthetase  45.37 
 
 		 319 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3973  glutathione synthetase  46.6 
 
 		 316 aa  279  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1152  glutathione synthetase  45.81 
 
 		 320 aa  279  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0482  glutathione synthetase  44.84 
 
 		 317 aa  278  6e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.580777  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2401  glutathione synthetase  49.67 
 
 		 313 aa  278  8e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3225  glutathione synthetase  46.6 
 
 		 315 aa  278  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00267386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3766  glutathione synthetase  47.1 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.725262  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1811  glutathione synthetase  45.37 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0574  glutathione synthetase  46.93 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000193905  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1253  glutathione synthetase  44.34 
 
 		 320 aa  276  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.271489  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3438  glutathione synthetase  45.63 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.214416  hitchhiker  0.00218155 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3334  glutathione synthetase  45.63 
 
 		 315 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.394258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3269  glutathione synthetase  45.63 
 
 		 315 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0503144  normal  0.0498141 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3342  glutathione synthetase  45.63 
 
 		 315 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162604  normal  0.353021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3258  glutathione synthetase  45.63 
 
 		 315 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000011434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>