19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2173 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2173  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  169  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0275758  hitchhiker  0.00000422863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0902  hypothetical protein  40.85 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0997  hypothetical protein  43.08 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1553  hypothetical protein  40.91 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1890  hypothetical protein  44.78 
 
 
72 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2152  hypothetical protein  42.42 
 
 
276 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6281  hypothetical protein  38.18 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267708  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2995  hypothetical protein  38.46 
 
 
253 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4282  hypothetical protein  37.31 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1157  hypothetical protein  43.33 
 
 
73 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1458  hypothetical protein  43.94 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329417  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0700  hypothetical protein  38.98 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0230  hypothetical protein  31.75 
 
 
175 aa  43.9  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0254  hypothetical protein  31.75 
 
 
175 aa  43.9  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4377  hypothetical protein  28.33 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1507  hypothetical protein  36.99 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.116491  normal  0.0112216 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0034  hypothetical protein  37.14 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176375  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  33.77 
 
 
85 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1537  hypothetical protein  30.88 
 
 
258 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>