More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_R0029 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_R0029  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0029  tRNA-Ile  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.303638  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0030  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0035  tRNA-Ile  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.15056  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0051  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00198263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0019  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000012543  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0013  tRNA-Ile  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0131677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0023  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0208908  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0043  tRNA-Ile  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0002  tRNA-Ile  93.06 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0015  tRNA-Ile  93.06 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.173828  normal  0.314939 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0081  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0040  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0038  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0085  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0099  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0089  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0002  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0033  tRNA-Ile  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0008  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0032  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000441039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0036  tRNA-Ile  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0220813  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0005  tRNA-Ile  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0053  tRNA-Ile  89.74 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.154517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0040  tRNA-Ile  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.111959 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0055  tRNA-Ile  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 80 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0019  tRNA-Ile  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000162954  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0795  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0015  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000271401  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0025  tRNA-Ile  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532399  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2506  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2772  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2212  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2459  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0049  tRNA-Ile  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0069  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0007  tRNA-Ile  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00629205  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0055  tRNA-Ile  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  92.98 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>