More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_t0085 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_t0038  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0085  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  97.3 
 
 		 77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0019  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000162954  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0025  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000532399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0055  tRNA-Ile  98.25 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000360648  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  96.61 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0040  tRNA-Ile  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0007  tRNA-Ile  98.04 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00629205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0051  tRNA-Ile  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00198263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0019  tRNA-Ile  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000012543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0029  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  98 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28350  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.145936 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00070  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000758823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0001  tRNA-Ile  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000567837 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0069  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2707  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000190822  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0004  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000271401  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0795  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0002  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000539151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0004  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000076362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t03  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0015  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0026  tRNA-Ile  96.23 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0009  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0767985  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0004  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000939428  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0004  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301418 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2506  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2772  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2212  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2459  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0009  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.425741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2800  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000121659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2075  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00411358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0004  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.147077  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0024  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0009  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618734  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 79 bp  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0047  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.026073  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0052  tRNA-Ile  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0029428  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0032  tRNA-Ile  96.23 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0085  tRNA-Ile  96.08 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0058  tRNA-Ile  96.08 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.646695 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0064  tRNA-Ile  96.08 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>