45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3747 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3747  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 126 aa  261  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2166  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.41 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0593975  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.58 
 
 		 125 aa  125  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136753  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0145  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.2 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1581  glyoxalase family protein  46.34 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2495  hypothetical protein  32 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1045  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.702459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3586  glyoxalase family protein  35.82 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3081  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0448436  normal  0.495021 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2124  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.38 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0194253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2789  glyoxalase family protein  35.16 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0913  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.92 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.943234 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3000  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.38 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0247436  normal  0.442163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0992  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.13 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.75 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0760824  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04755  lactoylglutathione lyase  32.81 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1016  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.59 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144748  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0886  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.03 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1111  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00744956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3280  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0562613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1078  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1009  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001042  lactoylglutathione lyase  31.25 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0389  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.6 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.258603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4998  putative glyoxalase  28.91 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.519054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0088  glyoxalase family protein  29.23 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.48 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148195  normal  0.0502587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0511  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.4 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1598  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.05 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.548689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1730  glyoxalase family protein  29.55 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00522629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1946  glyoxalase family protein  29.55 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5587800000000002e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1752  glyoxalase family protein  29.55 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000441097  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3968  hypothetical protein  27.34 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.95 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.03 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1910  glyoxalase family protein  29.63 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000915588  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2289  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.1 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.713044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2017  glyoxalase family protein  28.89 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000114361  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1773  glyoxalase family protein  29.63 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00831345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  25.76 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3237  lactoylglutathione lyase  25.19 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4214  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.18 
 
 		 129 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.421279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0524  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.77 
 
 		 133 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1995  glyoxalase family protein  27.27 
 
 		 139 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>