More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3330 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008043  TM1040_3330  ABC transporter related  100 
 
 
241 aa  481  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.274537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2948  sulfate/thiosulfate transporter subunit  58.23 
 
 
364 aa  274  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.579552  normal  0.586693 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1239  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.81 
 
 
365 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.525663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3652  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.81 
 
 
365 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.992152  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1257  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.81 
 
 
365 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109195 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2577  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.81 
 
 
365 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2558  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.81 
 
 
365 aa  271  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02322  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.81 
 
 
365 aa  270  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02283  hypothetical protein  57.81 
 
 
365 aa  270  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2794  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.38 
 
 
365 aa  269  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2708  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.38 
 
 
365 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.882672  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2586  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.38 
 
 
365 aa  268  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2701  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.38 
 
 
365 aa  268  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2807  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.38 
 
 
365 aa  268  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2635  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.38 
 
 
365 aa  268  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2677  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.38 
 
 
364 aa  268  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.81 
 
 
363 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1411  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.81 
 
 
363 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  57.38 
 
 
363 aa  266  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0079  sulfate/thiosulfate transporter subunit  54.01 
 
 
377 aa  265  4e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.58607  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.43 
 
 
356 aa  264  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.9 
 
 
354 aa  265  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3454  sulfate/thiosulfate transporter subunit  55.27 
 
 
362 aa  261  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.1858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0649  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.17 
 
 
373 aa  257  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3192  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.16 
 
 
376 aa  257  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.246669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3095  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.16 
 
 
376 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1136  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.21 
 
 
240 aa  256  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3015  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.16 
 
 
376 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0509545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1002  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.74 
 
 
376 aa  254  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3602  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  52.74 
 
 
376 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 
351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 
351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 
351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  52.32 
 
 
360 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1063  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.9 
 
 
376 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 
351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 
351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1797  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.22 
 
 
371 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 
351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 
351 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 
330 aa  252  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.88 
 
 
351 aa  253  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3295  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.48 
 
 
376 aa  252  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.53786 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  52.5 
 
 
351 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  54.94 
 
 
345 aa  251  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  54.43 
 
 
348 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.48 
 
 
369 aa  251  9.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.59 
 
 
375 aa  251  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  50.63 
 
 
329 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.16 
 
 
375 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.16 
 
 
375 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1096  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.05 
 
 
376 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  55.27 
 
 
371 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  50.63 
 
 
329 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0994  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.05 
 
 
376 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.27 
 
 
371 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  50.21 
 
 
326 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  50.21 
 
 
329 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  54.51 
 
 
349 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  51.05 
 
 
359 aa  249  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.59 
 
 
374 aa  249  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.19 
 
 
374 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.74 
 
 
371 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.16 
 
 
355 aa  249  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0068  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  53.48 
 
 
376 aa  248  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.01 
 
 
365 aa  248  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.16 
 
 
369 aa  248  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 
329 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  52.74 
 
 
348 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.16 
 
 
369 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 
330 aa  248  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.32 
 
 
365 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  49.79 
 
 
326 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4182  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.43 
 
 
239 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.564485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 
332 aa  247  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.37 
 
 
329 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.22 
 
 
348 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 
329 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  51.48 
 
 
343 aa  247  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  52.74 
 
 
362 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  50.21 
 
 
323 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  52.36 
 
 
378 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  53.22 
 
 
348 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  51.48 
 
 
367 aa  246  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0791  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.59 
 
 
239 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3858  sulfate/molybdate ABC transporter ATPase  54.47 
 
 
257 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  53.65 
 
 
367 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.1 
 
 
357 aa  246  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.95 
 
 
357 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.87 
 
 
352 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 
330 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.87 
 
 
352 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 
330 aa  246  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.9 
 
 
373 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.37 
 
 
329 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  53.22 
 
 
349 aa  245  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  51.05 
 
 
352 aa  245  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.05 
 
 
355 aa  245  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.25 
 
 
352 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.25 
 
 
352 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>