22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1867 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1867  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  346  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0724  hypothetical protein  61.95 
 
 		 149 aa  148  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.108952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3682  hypothetical protein  45.24 
 
 		 175 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.840145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2301  hypothetical protein  50 
 
 		 147 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3369  hypothetical protein  52.94 
 
 		 165 aa  114  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.867444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0866  hypothetical protein  38.24 
 
 		 153 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.171288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6041  hypothetical protein  49.11 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.970972  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0940  hypothetical protein  33.86 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0606896  hitchhiker  0.00778912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3997  hypothetical protein  33.61 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0383  hypothetical protein  37.61 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00782707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0934  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0415  hypothetical protein  36.21 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0438215  hitchhiker  0.000233911 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2245  hypothetical protein  35.78 
 
 		 135 aa  52  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.702566  normal  0.472151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2202  conserved hypothetical protein; putative secreted protein  35.78 
 
 		 135 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2520  hypothetical protein  36.79 
 
 		 135 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4456  hypothetical protein  37.25 
 
 		 133 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1081  hypothetical protein  53.33 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2142  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05688  hypothetical protein  30.5 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2190  hypothetical protein  30.83 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2359  hypothetical protein  30.4 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0847029  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000073  hypothetical protein  30.83 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>