252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1961 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  100 
 
 
79 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  53.33 
 
 
80 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  42.86 
 
 
81 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  43.04 
 
 
80 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  46.75 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  46.75 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  40.26 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  42.86 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  42.86 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  39.47 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  39.47 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  42.86 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  44.87 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  46.05 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  42.67 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  41.33 
 
 
84 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  37.33 
 
 
83 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  41.33 
 
 
84 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  38.67 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  37.97 
 
 
82 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  37.97 
 
 
82 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  40 
 
 
84 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  40 
 
 
83 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09531  BolA-like protein  35.53 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.336163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1023  BolA family protein  39.47 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15015  normal  0.871114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  45.07 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  40.26 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  37.66 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5266  BolA family protein  42.47 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  33.78 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  42.86 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2882  BolA family protein  40.85 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.102298  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  38.96 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  43.66 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  38.67 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2742  BolA-like protein  46.77 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2783  BolA family protein  39.73 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  38.46 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  50 
 
 
101 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  38.67 
 
 
84 aa  57.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  38.67 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  38.96 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  38.67 
 
 
83 aa  57.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  50 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2762  BolA family protein  44 
 
 
79 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0676  BolA family protein  40.79 
 
 
75 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  48.08 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  46.05 
 
 
82 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  42.47 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  42.67 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0500  BolA family protein  38.67 
 
 
84 aa  57  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  36.36 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  36 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  42.67 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2172  BolA-like protein  38.96 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0027  BolA/YrbA family protein  34.67 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  43.66 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  41.33 
 
 
92 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  34.67 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.181155 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.36 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  36.36 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  50 
 
 
98 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  38.67 
 
 
82 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  36.36 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  50 
 
 
98 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  36.36 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  37.33 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  36.36 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  36.36 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  36.36 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  44.59 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  43.66 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  50 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  36.36 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2666  BolA family protein  39.47 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.306779  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  34.62 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0893  BolA family protein  37.97 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0866848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  48.15 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0717  transcriptional regulator BolA  33.7 
 
 
92 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.541165  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  36 
 
 
84 aa  54.7  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14721  BolA-like protein  36 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0966227  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  41.33 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  46.15 
 
 
102 aa  53.9  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1660  BolA family protein  38.98 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168769  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  35.06 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  35.06 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  35.06 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  35.06 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1584  BolA family protein  41.43 
 
 
92 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0325559 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  35.06 
 
 
84 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0640  BolA-like protein  36 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0762  hypothetical protein  39.47 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  42.25 
 
 
81 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  46.3 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  32 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  34.25 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  34.21 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1597  BolA family protein  37.97 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0816624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  31.17 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  34.72 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>