69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1892 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1892  protein of unknown function DUF302  100 
 
 
134 aa  274  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1108  protein of unknown function DUF302  59.06 
 
 
128 aa  156  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.171345  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2156  hypothetical protein  51.94 
 
 
131 aa  147  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.612651  normal  0.115283 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0210  protein of unknown function DUF302  56.69 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279371  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2073  protein of unknown function DUF302  53.6 
 
 
131 aa  140  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2447  hypothetical protein  53.6 
 
 
131 aa  140  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2368  hypothetical protein  51.15 
 
 
131 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1382  protein of unknown function DUF302  50.79 
 
 
133 aa  138  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0692237  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2724  protein of unknown function DUF302  52.76 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0628237  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0925  protein of unknown function DUF302  48.03 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0404  hypothetical protein  41.73 
 
 
129 aa  124  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4400  hypothetical protein  46.72 
 
 
128 aa  120  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2285  hypothetical protein  44.88 
 
 
128 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0451006  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3053  hypothetical protein  45.53 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5680  hypothetical protein  45.24 
 
 
128 aa  116  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18352  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3125  hypothetical protein  43.75 
 
 
132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1964  protein of unknown function DUF302  44.44 
 
 
280 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2260  protein of unknown function DUF302  43.65 
 
 
280 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0505  protein of unknown function DUF302  50 
 
 
136 aa  110  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23213  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0138  protein of unknown function DUF302  46.15 
 
 
135 aa  110  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0504  hypothetical protein  46.56 
 
 
135 aa  110  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570987  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0833  protein of unknown function DUF302  45.38 
 
 
141 aa  110  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5410  hypothetical protein  46.56 
 
 
135 aa  110  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0277213 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2890  hypothetical protein  42.86 
 
 
128 aa  110  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5390  hypothetical protein  46.56 
 
 
135 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0540  hypothetical protein  42.97 
 
 
135 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.451768  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3939  hypothetical protein  46.92 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3601  hypothetical protein  46.92 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108169 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3031  protein of unknown function DUF302  41.46 
 
 
138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2269  hypothetical protein  49.11 
 
 
128 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228158  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4881  hypothetical protein  49.11 
 
 
128 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4093  hypothetical protein  45.38 
 
 
133 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4018  hypothetical protein  45.38 
 
 
133 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4248  hypothetical protein  45.38 
 
 
133 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.472325  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0981  hypothetical protein  43.18 
 
 
131 aa  104  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4074  protein of unknown function DUF302  46.96 
 
 
129 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4042  protein of unknown function DUF302  46.96 
 
 
129 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2773  protein of unknown function DUF302  41.09 
 
 
132 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0357  protein of unknown function DUF302  41.86 
 
 
143 aa  103  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1910  hypothetical protein  44.74 
 
 
114 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468377  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1826  hypothetical protein  42.86 
 
 
137 aa  103  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37864  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3932  hypothetical protein  43.9 
 
 
129 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3638  hypothetical protein  42.06 
 
 
142 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4478  hypothetical protein  43.75 
 
 
131 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2335  hypothetical protein  49.04 
 
 
128 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000793507  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1827  hypothetical protein  40.8 
 
 
135 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2575  protein of unknown function DUF302  42.62 
 
 
144 aa  101  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000565546  decreased coverage  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3686  hypothetical protein  40.48 
 
 
132 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.829007  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0500  hypothetical protein  43.1 
 
 
123 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227821  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3677  hypothetical protein  39.1 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134644  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5697  hypothetical protein  39.1 
 
 
137 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141635  normal  0.71056 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5312  hypothetical protein  39.1 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849521  normal  0.398368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3468  hypothetical protein  42.34 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3831  hypothetical protein  41.35 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3752  hypothetical protein  41.23 
 
 
143 aa  92  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0970  hypothetical protein  38.79 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354639 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4222  protein of unknown function DUF302  42.06 
 
 
127 aa  90.5  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0142  hypothetical protein  39.17 
 
 
134 aa  88.6  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2887  protein of unknown function DUF302  30.83 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1248  protein of unknown function DUF302  34.23 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0155671  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4277  protein of unknown function DUF302  34.13 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.486441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1112  protein of unknown function DUF302  38.55 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2611  protein of unknown function DUF302  36.59 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0266  protein of unknown function DUF302  32.84 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3325  protein of unknown function DUF302  32.52 
 
 
146 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.847441  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2146  hypothetical protein  33.03 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1263  hypothetical protein  23.85 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191336  unclonable  0.00000000979436 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1854  hypothetical protein  25.51 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1435  hypothetical protein  23.58 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.436424  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>