More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2665 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0523  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.94 
 
 
498 aa  714    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0931485 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2665  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
504 aa  1043    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06740  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  72.18 
 
 
506 aa  736    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.725577  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3214  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  70.91 
 
 
503 aa  746    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978494  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0834  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  68.71 
 
 
507 aa  700    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00885026  hitchhiker  0.000156856 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0407  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  71.23 
 
 
506 aa  759    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0111575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.73 
 
 
497 aa  686    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000239611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0394  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.2 
 
 
500 aa  706    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01810  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  69.35 
 
 
505 aa  706    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139734 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.35 
 
 
485 aa  295  9e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.74 
 
 
508 aa  292  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.65 
 
 
483 aa  290  4e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.31 
 
 
503 aa  287  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.64 
 
 
504 aa  288  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.35 
 
 
482 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.35 
 
 
482 aa  287  4e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.37 
 
 
488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3287  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  38.35 
 
 
484 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000039579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  37.24 
 
 
484 aa  281  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.51 
 
 
490 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0207  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.29 
 
 
507 aa  270  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.96 
 
 
493 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  37.3 
 
 
504 aa  269  8e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1137  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.21 
 
 
488 aa  269  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0697  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.09 
 
 
490 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0725248  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2359  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.57 
 
 
488 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.885257 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.64 
 
 
497 aa  267  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0011  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.7 
 
 
487 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.7 
 
 
487 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.7 
 
 
487 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.7 
 
 
487 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.7 
 
 
487 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.34316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0014  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.7 
 
 
487 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120798  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.29 
 
 
487 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.49 
 
 
487 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.71 
 
 
487 aa  264  3e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0288  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.92 
 
 
486 aa  263  4.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0008  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.88 
 
 
487 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.303266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.88 
 
 
488 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0012  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.49 
 
 
487 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0594668  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.7 
 
 
496 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.61 
 
 
493 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5306  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.29 
 
 
487 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3293  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.16 
 
 
488 aa  260  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1012  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.49 
 
 
498 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.155508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1313  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.2 
 
 
490 aa  261  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.905009  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.87 
 
 
486 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  35.26 
 
 
484 aa  259  6e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2646  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.96 
 
 
488 aa  259  7e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1234  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.16 
 
 
488 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1556  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.33 
 
 
486 aa  259  8e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1305  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  38.16 
 
 
488 aa  259  8e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.57 
 
 
483 aa  259  9e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0009  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.29 
 
 
488 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.97 
 
 
487 aa  258  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1235  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.96 
 
 
488 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.916768  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.74 
 
 
485 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.66 
 
 
489 aa  257  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0948  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.79 
 
 
486 aa  256  6e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.34 
 
 
485 aa  256  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.48 
 
 
514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1379  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.96 
 
 
488 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.281369  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.7 
 
 
489 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2999  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.96 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1200  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.88 
 
 
492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2984  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.96 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3142  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.96 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1269  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.14 
 
 
488 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000336634  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004341  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.86 
 
 
488 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1559  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.93 
 
 
490 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1992  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.4 
 
 
493 aa  253  7e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.369153  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1687  hypothetical protein  34.73 
 
 
490 aa  252  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1688  hypothetical protein  34.73 
 
 
490 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.91 
 
 
486 aa  252  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01076  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.86 
 
 
487 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.14 
 
 
496 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.09 
 
 
485 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1297  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.94 
 
 
488 aa  251  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.724136  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.01 
 
 
488 aa  250  4e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35 
 
 
492 aa  250  5e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.83 
 
 
489 aa  250  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3596  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  37.33 
 
 
487 aa  249  9e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000202307  normal  0.660698 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2729  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.33 
 
 
487 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0179443  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.08 
 
 
476 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3508  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.38 
 
 
498 aa  248  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1160  IMP dehydrogenase  33.93 
 
 
493 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08496  putative inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.2 
 
 
490 aa  247  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0788  IMP dehydrogenase  35.29 
 
 
497 aa  247  4e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.11 
 
 
485 aa  247  4e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0011  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.76 
 
 
494 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0737a  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.66 
 
 
487 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1886  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.69 
 
 
485 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0225  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.11 
 
 
493 aa  246  9e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1193  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.73 
 
 
490 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0366  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.68 
 
 
516 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.213754 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0742  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.81 
 
 
510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00516677  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1488  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.7 
 
 
497 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2558  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.27 
 
 
484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2261  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  36.27 
 
 
484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.22 
 
 
486 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>