12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2520 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1829  hypothetical protein  98.12 
 
 
426 aa  843    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2520  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  859    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000179634  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3935  hypothetical protein  26.32 
 
 
361 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00372357  hitchhiker  0.000463304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5609  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.78 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.93148  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1877  hypothetical protein  24.11 
 
 
158 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3391  putative peptidase A2A  30.83 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3810  hypothetical protein  22.87 
 
 
625 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580325  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3870  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.06 
 
 
422 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.3843  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2763  peptidase A2A  22.46 
 
 
342 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000167173 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0600  hypothetical protein  22.53 
 
 
314 aa  46.6  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0088175 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1692  hypothetical protein  23 
 
 
321 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.272478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1274  hypothetical protein  25.13 
 
 
403 aa  43.1  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00244151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>